Diferența dintre secvențierea întregului genom și secvențierea exome
Share
diferența cheie între secvențierea întregului genom și secvențierea exome este că secvențe de secvențiere genomului întreg întregul genom al unui organism, în timp ce secvențele de secvențiere a exomei conțin doar exomul sau genele care codifică proteinele unui organism.
Secvențierea este o tehnică care determină ordinea exactă a nucleotidelor într-o moleculă de ADN specială. Aceasta reflectă doar ordinea corectă a celor patru baze; adenina (A), guanina (G), citozina (C) și timina (T) într-un fragment ADN. Există mai multe metode de secvențiere, cum ar fi secvențierea lui Sanger, secvențierea următoarei generații etc. Mai mult decât atât, fie genomul complet al unui organism (secvențierea întregului genom), fie numai genele care codifică proteinele din genom (secvențierea exomei) pot fi supuse secvențierii.
CUPRINS
1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce este secventierea genomului întreg
3. Ce este Sequencing-ul Exome
4. Asemănări între secvențierea întregului genom și secvențierea exome
5. Comparație între părți - secvențierea întregului genom vs secvențierea exome în formă tabulară
6. rezumat
Ce este secventierea genomului întreg?
Genomul uman conține aproape trei miliarde de perechi de baze de ADN. Secvențierea întregului genom este o metodă care secvențează genomul complet al unui organism. Prin urmare, în secvențierea întregului genom, se are în vedere întreaga colecție de molecule de ADN, incluzând exomi, introni, spații intergenice etc. În plus, secvențele de secvențiere a genomului nu numai genomul care se află în interiorul nucleului, dar și ADN-ul mitocondrial.
Figura 01: Secvențierea întregului genom
În pregătirea pentru această secvențiere, prima etapă este extragerea întregului ADN. Apoi, ADN-ul extras suferă procedura de secvențiere utilizând o metodă adecvată de secvențiere. Analizând secvențele rezultate, utilizând un instrument de bioinformatică, putem afla bolile rare, cancerul, bolile infecțioase etc..
Ce este Sequencing-ul Exome?
Exome este o parte a genomului care conține aproximativ 1,5% din genom și este colecția de exoni. Exonii sunt secvențele care transcriu în ARNm și apoi în produsul proteic final. Prin urmare, secvențializarea secvențelor exome cuprinde întreaga secvență de codificare a proteinei din genom. Secvențierea secvențelor secvențiale dezvăluie tulburările genetice, deoarece majoritatea tulburărilor genetice apar datorită mutațiilor genelor care codifică proteinele. Prin urmare, procesele de diagnosticare a tulburărilor genetice utilizează frecvent secvențierea exomei ca metodă de diagnosticare a bolii. De asemenea, atunci când se compară cu cererea de secvențiere a genomului întreg pentru testarea genetică, secvențierea exomei necesită mai puțin timp pentru a fi angajată și este mai puțin costisitoare.
Figura 02: Sequencing Exome
În secvențierea exomei, în primul rând, este necesar să se selecteze numai secvențele de codificare a proteinei din ADN-ul total. Rețineți că oamenii au aproximativ 180000 de secvențe de codificare a proteinelor. Apoi, exomul este secvențiat folosind o metodă de secvențiere cu tranzit mare.
Care sunt asemănările dintre întreaga secvențiere a genomului și secvențierea Exome?
- Secvențierea genomului întreg și secvențarea Exome sunt două aplicații de secvențiere.
- Ambele metode sunt utile în determinarea ordinii corecte a secvenței de nucleotide în ambele metode.
- De asemenea, bioinformatica ajută ambele tehnici să analizeze datele.
Care este diferența dintre secvențierea întregului genom și secvențierea Exome?
Secvențele genomice secvențiale întregi întregul ADN al genomului unui organism, în timp ce secvențele secvențiale exomează numai secvențele de codificare a proteinei din genom. Prin urmare, aceasta este diferența fundamentală dintre secvențierea întregului genom și secvențierea exomei. De asemenea, deși ambele metode se utilizează pe scară largă pentru a determina ordinea corectă a secvenței de nucleotide, secvențierea întregului genom este costisitoare și consumatoare de timp decât secvențierea exomei.
Tabela de mai jos prezintă tabela de diferență între secvențierea întregului genom și secvențierea exomei.
Rezumat - Secvențierea întregului genom vs secvențierea exome
Secvențierea arată ordinea exactă a bazelor într-un fragment ADN și poate fi fie secvențierea întregului genom, fie secvențierea exomei. Aici, întregul secvențiere a genomului genomului complet al unui organism, în timp ce secvențializarea secvențială a exomei numai secvențele de codificare a proteinelor din genom. Având în vedere aplicațiile lor, secvențierea întregului genom este utilă în analizarea aberațiilor genetice, cum ar fi variații, deleții, inserții, inserții, inserții etc. în întregul genom, în timp ce secvențializarea exomei este utilă pentru detectarea bolilor genetice. Prin urmare, aceasta este diferența între secvențierea întregului genom și secvențierea exomei.
Referinţă:
1. "Întregul genom vs. celulă-Exome Sequencing vs. Panouri de secvență orientate." Healio, SLACK Incorporated. Disponibil aici
2. Ce sunt secventierea intreaga exome si secventierea genomului intreg? - Genetica Home Reference - NIH. "Biblioteca Nationala de Medicina din SUA, National Institutes of Health. Disponibil aici
Datorită fotografiei:
1. "Secvențierea întregului genom de pușcă versus secvențierea ierarhică a pușcașului de pușcă" Prin Commins, J., Toft, C., Fares, M. A. - "Metodele de biologie computațională și aplicarea lor la genomica comparativă a bacteriilor endobunculare simbiotice ale insectelor". (CC BY-SA 2.5) prin intermediul Commons Wikimedia
2. "Procesul de secvențiere Exome 1a" de SarahKusala - Lucrare proprie, (CC BY 3.0) prin intermediul Commons Wikimedia
