Care este diferența dintre microsatelit și minisatelit

principala diferență între microsatelit și minisatelit este asta unitatea repetată a unui microsatelit constă din 2-6 perechi de baze, în timp ce unitatea repetată a unui minisatelit constă din 10-100 de perechi de baze. Mai mult, o matrice de microsatelit conține 5-200 repetări, în timp ce o matrice minisatelitară conține 10-1500 repetări.

Microsatelit și minisatelit sunt două tipuri de ADN repetitiv în genom. Utilizarea principală a ADN-ului microsatelit este pentru scopurile de amprentare a ADN-ului, în timp ce cea a minisatellitelor este pentru testarea paternității, deoarece acestea apar în grupuri de familie.

Domenii cheie acoperite

1. Ce este Microsatelit?
     - Definiție, structură, importanță
2. Ce este Minisatelit
     - Definiție, structură, importanță
3. Care sunt asemănările dintre microsatelit și minisatelit
     - Schița caracteristicilor comune
4. Care este diferența dintre microsatelit și minisatelit
     - Compararea diferențelor cheie

Termeni cheie

DNA Fingerprinting, Microsatelit, Minisatelit, Testarea Paternității, ADN Repetitiv

Ce este Microsatelit?

Un microsatelit este o secvență repetată de 2-6 perechi de baze în genom. Deoarece este un tip de repetiții tandem cu secvențe scurte de nucleotide, microsateliturile sunt, de asemenea, cunoscute sub numele de scurte repetări tandem (STRs). Repetările nucleotidelor unice se numesc polimorfismul unic de nucleotide (SNP). Mai mult, microsateliții apar pe tot genomul. În genomul uman, repetările dinucleotidice apar la fiecare 30 000 de perechi de baze.

Figura 1: Analiza paternității

Mai mult, microsateliții sunt o regiune extrem de mutagena a genomului. Principala metodă de obținere a mutațiilor este prin alunecarea ADN-ului în timpul replicării. Secvențe microsatellite unice apar în cadrul familiilor. Prin urmare, utilizăm analiza microsateliților pentru testarea paternității. În plus, extinderea repetării microsatelitului trinucleotidic provoacă tulburări umane grave precum sindromul Fragile X și boala Huntington.

Ce este un Minisatelit?

Minisatelitul este o secvență repetată de perechi de 10-100 de baze din genom. Aici, unitatea repetată este oarecum mare și se numește a Motivul ADN. Un alt nume pentru minisatelit este numărul variabil de repetiții tandem (VNTRs). Numărul de VNTRs este foarte variabil în rândul persoanelor fizice. Unitatea repetitivă a unui minisatelit este bogată în GC.

Figura 2: Minisatelit

Datorită naturii extrem de variabile a minisatellitelor printre indivizi, oamenii de știință le folosesc pentru amprentarea ADN-ului. Ei folosesc, de asemenea, minisateliți ca markeri genetici în timpul analizei legăturii. Unele secvențe minisatellite sunt implicate în formarea cancerului oncogen asociat ras.

Asemănări între microsatelit și minisatelit

  • Microsatelit și minisatelit sunt două tipuri de ADN foarte repetitive, alcătuite din repetări tandem în genomul eucariot.
  • Desi nu au nici o functie atribuita in genom, ele sunt importante in mentinerea structurii genomului.
  • De asemenea, aceste secvențe de ADN nu apar în regiunile intergenice. Prin urmare, ele sunt ADN-ul care nu codifică.
  • În plus, ambele pot fi folosite în identificarea indivizilor.
  • Unele dintre ele pot fi asociate cu boli.
  • Ele apar ca benzi mici, întunecate în analiza gradientului densității CsCI.

Diferența dintre microsatelit și minisatelit

Definiție

Microsatelitul se referă la un set de secvențe de ADN repetate scurte într-un anumit locus dintr-un cromozom, care variază în număr în diferite persoane și astfel poate fi utilizat pentru amprente genetice în timp ce minisatelitul se referă la o formă de ADN polimorf, cuprinzând un număr variabil de repetări tandem , cu unități repetate de până la aproximativ 100 de nucleotide în lungime. Aceasta este diferența de bază dintre microsatelit și minisatelit.

Tip de repetări tandem

Microsateliturile sunt STR, în timp ce minisatelliții sunt VNTR-uri.

Apariţie

În plus, microsateliturile apar în principal pe tot genomul, în timp ce minisateliturile apar în principal la capetele genomului.

Dimensiunea unității de repetare

Mărimea unității repetate a unui microsatelit este de 2-6 perechi de baze, în timp ce dimensiunea unității repetate a unui minisatelit este de 10-100 perechi de baze. Aceasta este o diferență majoră între microsatelit și minisatelit.

Numărul de repetări per genom

O anumită unitate repetată apare de aproximativ 5-200 ori în genom în microsateliți, în timp ce o unitate repetată apare de 10-1 500 de ori în minisatelit.

Dimensiunea matricei

O altă diferență între microsatelit și minisatelit este că mărimea matricei de unități repetate este de 10-1000 de perechi de baze în microsateliți, în timp ce mărimea matricei de unități repetate este de 0,5-15 kb în microsateliți. 

Complexitatea array-ului

Gama de microsateliți este în principal omogenă, în timp ce gama de minisateliți este eterogenă.

Concluzie

Microsatelitul este un tip de ADN repetitiv în genomul eucariot cu secvențe repetitive lungi cu perechi de 2-6 baze. Acestea sunt larg răspândite pe tot parcursul genomului și pot fi utilizate pentru testarea paternității. Pe de altă parte, minisatelitul este un tip de ADN repetitiv cu secvențe repetitive lungi cu perechi de 10-100 de perechi de baze. Ele apar în principal la sfârșitul cromozomilor și pot fi folosite pentru amprentarea ADN-ului. Astfel, principala diferență între microsatelit și minisatelit este structura și importanța acestora.

Referinţă:

1. Ramel, C. "Mini- și microsateliți". Perspective privind sănătatea mediului105. Suppl 4 (1997): 781-789. Disponibil aici

Datorită fotografiei:

1. "Etapele de amprentare genetică" de Sneptunebear16 - Muncă proprie (CC BY-SA 4.0) prin Wikimedia Commons  
2. "VNTRexample" de Madelyndotson - Muncă proprie (CC BY-SA 4.0) prin Wikimedia Commons